Waki Ats Tsaqofi, menimba ilmu di Pesantren Al-Mizan Rangkasbitung, Lebak, Banten, di bawah asuhan K.H. Anang Azhari Alie, M.Pd.I (lulus 2010). Setelah 6 tahun menimba ilmu di pesantren tersebut, Waki melanjutkan pendidikan tinggi ke jenjang S1 di UIN Syarif Hidayatullah Jakarta pada tahun 2011, dengan fokus pada program studi Tarjamah. Ia menyelesaikan skripsinya yang berjudul Memahami Keislaman Penerbit Melalui Buku-buku Terjemahan: Studi Kasus Penerbit Serambi dan Penerbit Gema Insani Press di bawah bimbingan Prof. Dr. Sukron Kami, M.A., dan lulus pada tahun 2015 dengan predikat lulusan terbaik. Selama menjadi mahasiswa, Waki menerima penghargaan sebagai Mahasiswa Berprestasi dari Rektor UIN Syarif Hidayatullah Jakarta pada tahun 2013 dan 2015. Di luar prestasi akademisnya, ia juga aktif dalam berbagai organisasi, antara lain sebagai Ketua Divisi Sosial Himpunan Mahasiswa Jurusan (HMJ) Tarjamah (2013), Anggota Dewan Mahasiswa (Dema) Fakultas Adab dan Humaniora (2013-2014), Ketua Divisi Informasi dan Komunikasi Senat Mahasiswa (Sema) Universitas UIN Jakarta (2015), serta Sekretaris Pusat Penerjemahan dan Penerbitan Fakultas Adab dan Humaniora (2014-2016).

Setelah menamatkan studi di UIN Syarif Hidayatullah Jakarta, Waki mendalami ilmu Al-Qur’an, khususnya Qira’at ‘Ashim Riwayat Hafsh Thariq Asy-Syathibiyyah, di bawah bimbingan Dr. K.H. Ahmad Fathoni, M.A., pengasuh Pesantren Takhassus “IIQ Jakarta,” selama tiga tahun (2015-2018). Selain itu, ia bekerja sebagai penerjemah lepas di berbagai penerbit, seperti Pustaka Compass, Alo Indonesia, dan TransPustaka, serta mengajar di Pesantren Luhur Sabilussalam, Ciputat, pada malam hari.

Pada tahun 2017-2018, Waki menjadi Asisten Peneliti di Pusat Studi Timur Tengah dan Perdamaian Global (PSTPG) FISIP UIN Syarif Hidayatullah Jakarta, dan terlibat dalam penelitian tentang ekonomi kaum muda dan kebijakan kontra-terorisme di Nunukan, Kalimantan Utara. Untuk menambah wawasan dan keterampilannya, ia melanjutkan pendidikan Magister di Sekolah Pascasarjana UIN Syarif Hidayatullah Jakarta pada tahun 2017 dengan fokus pada lingustik. Di sela-sela studi, ia mendapatkan beasiswa untuk belajar bahasa Mandarin di Chongqing University, Tiongkok pada tahun 2018, sekaligus menyelesaikan program S2 di School of Foreign Languages and Cultures universitas tersebut. Pada tahun 2021, Waki bergabung sebagai dosen tetap di UIN Syarif Hidayatullah Jakarta.